La Dirección  de Asuntos Administrativos y Financieros tiene por misiones:

• asegurar el equilibrio financiero de la universidad;
• optimizar los recursos financieros para una mejor asignación;
• garantizar la producción y fiabilidad de la información contable (general y analítica) de acuerdo con las normas y estándares vigentes;
• generar informes analíticos por establecimiento y gestión;
• aplicar las reglas contables específicas a la actividad de la UEMF y su estado legal;
• garantizar la correcta ejecución e integridad de las operaciones de tesorería;
• asegurar la producción de cierres periódicos y anuales y establecer el archivo de cierre de cuentas; 
• garantizar el cumplimiento del manual de procedimientos contables;
• participar en operaciones de inventario y elaborar toda la información contable relacionada con los activos de la Universidad;
• alerta ante cualquier hecho que pueda alterar los activos de la UMF (activos fijos, clientes, acciones, etc.);
• conciliar los datos contables con los de las soluciones comerciales;
• garantizar la administración funcional del componente financiero del SI;
• participar en operaciones de auditoría y auditoría legal;
• interfaz con donantes para aspectos financieros;
• garantizar la relevancia de la información de la contabilidad analítica;
• desarrollar y seguir la implementación de herramientas para administrar los logros de UEMF;
• realizar análisis periódicos sobre la ejecución de los presupuestos anuales y hacer seguimiento de  los indicadores de rendimiento;
• establecer informes mensuales;
• participar en la mejora cualitativa de la información contable;
• garantizar el apoyo a los centros de la UEMF en términos de información presupuestaria;
• contribuir a todas las mejoras del SI;
• participar en el seguimiento presupuestario de las subvenciones;
• establecer y seguir programas de empleo para proyectos de investigación de la UEMF;
• garantizar el cumplimiento de los requisitos fiscales y sociales de la UEMF de conformidad con la normativa vigente;
• aplicar las normas de cumplimiento a las que está sujeta la UEMF (Oficina de cambio, aduanas…)