Le Comité de Coordination assure la coordination des activités des différentes entités, facultés, instituts, unités et centres de l'Université. Il a pour mission d’assurer les synergies, la mutualisation des moyens et de proposer les projets communs et structurants entre les différents Établissements.
Le Comité de coordination est composé, en plus du Président, des vice-Présidents, du Secrétaire Général, du Directeur des Affaires Administratives et Financières, de l’ensemble des Chefs d’Établissements et des différentes directions de l’Université.
Ce Comité se réunit au moins une fois par mois, et à chaque fois que le bon fonctionnement de l’Université l’exige.